«Михаил Михайлович, Вам не нужно рассказывать, что такое Красноярский край, – Вы родом из Красноярского края, много лет там работали, доросли там до заместителя губернатора, занимались экономикой и финансами края, а в центральном аппарате, в центре, занимались высшей школой, наукой. Сейчас Вы заместитель Министра финансов. Что говорить, Вы в курсе, в «материале» того, что такое Красноярский край для России, его значимости для страны в целом – и, мне кажется, вполне подошли к тому, чтобы возглавить такой важный субъект Российской Федерации, как Красноярский край.
Михаил Михайлович, Вы сами к этому готовы?», - сказал Путин в ходе беседы.
Михаил Котюков согласился с предложением, ответив: «Владимир Владимирович, спасибо большое за доверие. Максимально весь свой потенциал, который наработал, все возможности, которыми сегодня обладаю, буду применять для решения самых насущных, актуальных вопросов для жителей родного края. И рассчитываю на Вашу поддержку».
После этого, президент подписал Указ, которым назначил Михаила Котюкова временно исполняющим обязанности губернатора Красноярского края.
Михаилу Котюкову 46 лет, женат, воспитывает сына и дочь
С 1997 года работал в главном финансовом управлении администрации Красноярского края экономистом, затем начальником отдела.
С 2001 года — начальник финансового отдела ОАО «Красноярскагропромдорстрой».
В марте—июле 2007 года - проректор по экономике и финансам Сибирского федерального университета.
В июле 2007 года назначен заместителем губернатора Александра Хлопонина — главой департамента финансов Красноярского края.
С июля 2008 года — министр финансов, с декабря одновременно заместитель председателя правительства Красноярского края.
В апреле 2010 года возглавил департамент бюджетной политики в отраслях социальной сферы и науки Министерства финансов РФ.
13 июня 2012 года назначен заместителем министра финансов Российской Федерации Антона Силуанова.
С 25 октября 2013 года - руководитель Федерального агентства научных организаций (ФАНО), созданного в рамках реформы РАН.
18 мая 2018 года Указом Президента Российской Федерации был назначен Министром науки и высшего образования Российской Федерации.
4 марта 2020 — 20 апреля 2023 - Заместитель министра финансов Российской Федерации.